연구개발전담부서, 연구원 1명만 있어도 만들 수 있나요?

기업부설연구소를 만들기엔 인원이 부족한 회사가 먼저 검토하는 연구개발전담부서를 정리했습니다. 연구전담요원 1명으로 시작할 수 있는지, 그 1명의 자격 기준, 연구공간·기자재·연구 외 상시 종업원 요건, 세액공제율과 주의할 점을 담았습니다.

30초 핵심 답변

연구개발전담부서는 기업 규모와 관계없이 연구전담요원 1명 이상이면 만들 수 있습니다. 그 1명은 자연계 학사 이상 또는 기사 이상(중소기업은 전문학사·산업기사+경력 2년 등)이어야 하고, 고정 벽체·별도 출입문으로 구분된 연구공간(중소기업 등은 50㎡ 이하면 칸막이 가능)과 연구 전용 기자재, 연구 외 업무를 하는 상시 종업원도 갖춰야 합니다(2026년 11월 확인).

한눈에 보기

항목내용
무엇인가요회사 안에 연구개발만 담당하는 부서를 따로 만들어 신고하고 인정받는 제도
최소 인원연구전담요원 1명 이상 (기업 규모와 관계없이 동일)
연구원 자격자연계 학사 이상 또는 기사 이상 (중소기업은 전문학사·산업기사+연구 경력 2년, 특성화고·기능사+연구 경력 4년도 가능)
연구공간고정 벽체 + 별도 출입문의 독립공간 (중소기업 등은 50㎡ 이하면 칸막이 구분 가능)
그 밖의 요건연구 전용 기자재, 생산·영업 등 연구 외 업무를 하는 상시 종업원
신고rnd.or.kr 온라인 신고, 수수료 없음
세액공제중소기업 일반 연구·인력개발비: 지출액의 25% 또는 증가분의 50% (실제 연구개발비 요건 충족 시)
이후 단계연구원이 기업 유형별 기준(벤처 2명·소기업 3명 등)을 채우면 기업부설연구소로 전환 가능

기준은 한국산업기술진흥협회 신고관리시스템과 국세청 안내로 2026년 11월에 확인했습니다.

연구개발전담부서란 무엇인가요?

회사 안에 연구개발 업무만 담당하는 부서를 별도로 만들어 신고하고 인정받는 제도입니다. 기업부설연구소와 같은 법(「기업부설연구소등의 연구개발 지원에 관한 법률」)으로 인정받고, 신고 접수와 인정 업무는 한국산업기술진흥협회(KOITA)가 처리합니다.

연구개발은 하고 있는데 기업부설연구소를 만들기에는 아직 인원이 부족한 회사가 많이 찾습니다. 두 제도의 전체 비교는 기업부설연구소 vs 연구개발전담부서 차이에서 표로 확인하세요.

정말 연구원 1명으로도 되나요?

네. 기업부설연구소법 시행령 제6조는 기업의 연구개발부서에 연구전담요원 1명 이상을 요구합니다. 기업 규모와 관계없이 같은 기준입니다.

기업부설연구소는 벤처기업 2명, 소기업 3명(창업 3년까지 2명), 중기업 5명, 중견기업 7명, 대기업 10명 이상이 필요하기 때문에 소규모 회사나 처음 R&D 조직을 만드는 회사가 전담부서를 먼저 검토하는 경우가 많습니다.

다만 그 1명은 자격 기준을 충족하고 연구개발 업무를 전담해야 합니다.

  • 모든 기업: 자연계 학사 이상, 또는 기술·기능 분야 기사 이상
  • 중소기업 추가 인정: 자연계 전문학사·산업기사 + 연구 경력 2년 이상, 특성화고·마이스터고 졸업자·기능사 + 연구 경력 4년 이상

대표자는 원칙적으로 연구전담요원이 될 수 없지만, 창업 3년 이내 소기업의 대표가 자격을 갖추고 연구개발 업무를 하면 예외로 인정됩니다. 영업·생산·총무 업무를 함께 보는 직원은 인정받기 어렵습니다. 자세한 기준은 기업부설연구소 연구원 자격 조건을 참고하세요.

연구원 말고 또 무엇을 준비해야 하나요?

연구원만 있다고 되는 것은 아닙니다. 기본적으로 네 가지를 갖춘다고 생각하시면 쉽습니다.

  1. 연구전담요원 — 자격을 갖추고 연구개발 업무만 맡는 직원 1명 이상
  2. 연구공간 — 고정된 벽체와 별도 출입문으로 다른 부서와 구분된 공간. 중소기업·벤처기업 등이 50㎡를 넘는 면적을 확보할 수 없으면 칸막이로 구분해도 됩니다. 최소 면적 숫자는 없고, 상시 근무와 기자재 설치에 필요한 면적이면 됩니다.
  3. 연구용 기자재 — 연구개발에만 쓰는 장비나 소프트웨어 등을 연구공간 안에 둘 것
  4. 연구 외 업무를 하는 상시 종업원 — 연구전담요원이 연구에만 전념할 수 있도록 생산·판매·영업 등을 맡는 직원을 따로 둘 것

연구공간을 증빙할 서류(건축물대장, 임대차계약서 등)를 처음부터 챙겨 두면 보완 요청을 줄일 수 있습니다. 주거용 건물(아파트 포함)·가건물에는 전담부서를 둘 수 없습니다.

전담부서를 만들면 세액공제를 받을 수 있나요?

대표님들이 가장 궁금해하시는 부분입니다. 조세특례제한법 제10조에 따라 중소기업은 일반 연구·인력개발비에 대해 당해 연도 지출액의 25% 또는 직전 연도보다 늘어난 금액의 50% 방식으로 세액공제를 받을 수 있습니다(국세청 안내, 2026년 11월 확인). 연구개발전담부서도 실제 연구개발 활동과 비용 요건을 갖추면 이 제도를 활용할 수 있습니다.

전담부서가 있다고 모든 비용이 연구개발비가 되지는 않습니다

실제로 연구개발을 하고 있는지, 그 비용이 인정되는 연구개발비인지 함께 확인해야 합니다. 부서를 만든 것만으로 세액공제가 자동으로 적용되지는 않으니 신청 전에 세무 전문가와 확인하세요.

인증용으로만 만들어 두면 괜찮을까요?

권하지 않습니다. 벤처·이노비즈 인증을 받으려고 직원 한 명을 세워 전담부서를 만들어 둔 회사에 2년 뒤 실태조사 통보가 온 사례가 있습니다. 실제 연구를 하지 않아 연구일지를 쓰기도 어려운 상황이었고, 결국 자진취소를 검토하게 되었습니다.

한국산업기술진흥협회는 연구소·전담부서 현장조사를 별도 사전 연락 없이 수시로 실시하고, 보완사항을 조치하지 않으면 인정이 취소될 수 있다고 안내합니다. 만들기 전에 실제로 유지할 수 있는 구조인지 먼저 따져 보세요. 점검 방법은 연구소 실태조사 대비 체크리스트에 정리했습니다.

나중에 기업부설연구소로 바꿀 수 있나요?

네. 처음부터 기업부설연구소를 만들기 어렵다면 연구개발전담부서로 시작한 뒤 연구원이 기업 유형별 기준 인원을 채우면 연구소로 전환하는 방법이 있습니다. 연구소 설립 조건은 기업부설연구소 종합 가이드를 참고하세요.

연구개발을 실제로 하고 있다면 그냥 지나치지 말고, 지금 인력과 공간으로 인정이 가능한지 먼저 확인해 보시길 권합니다.

자주 묻는 질문

Q1. 연구개발전담부서는 연구원 몇 명부터 가능한가요?

연구전담요원 1명부터 가능합니다. 기업 규모와 관계없이 같은 기준이며, 기업부설연구소(벤처 2명·소기업 3명·중기업 5명 등)보다 인력 기준이 낮습니다(2026년 11월 확인).

Q2. 연구원 1명만 있으면 바로 신청할 수 있나요?

연구원만으로는 부족합니다. 고정 벽체와 출입문으로 구분된 연구공간, 연구 전용 기자재, 그리고 연구 외 업무를 하는 상시 종업원도 갖춰야 합니다.

Q3. 대표 혼자 연구원을 맡아도 되나요?

대표자는 원칙적으로 연구전담요원이 될 수 없습니다. 다만 창업 3년 이내 소기업의 대표가 자격을 갖추고 연구개발 업무를 하면 예외로 인정됩니다.

Q4. 전담부서 공간은 몇 ㎡ 이상이어야 하나요?

정해진 최소 면적은 없습니다. 원칙은 고정 벽체와 별도 출입문으로 구분하는 것이고, 중소기업·벤처기업 등이 50㎡를 넘는 면적을 확보할 수 없으면 칸막이 구분도 인정됩니다.

Q5. 전담부서도 연구·인력개발비 세액공제를 받을 수 있나요?

실제 연구개발 활동과 비용 요건을 갖추면 활용할 수 있습니다. 중소기업 일반 연구·인력개발비 공제율은 지출액의 25%(또는 증가분의 50%)이지만, 모든 비용이 자동으로 인정되지는 않습니다.

Q6. 하나뿐인 연구원이 퇴사하면 어떻게 되나요?

퇴사한 연구원은 변경신고로 삭제해야 하고, 인원 기준에 못 미치면 보완명령(원칙 1개월, 신청 시 2개월 범위 연장)을 받을 수 있습니다. 계속 운영하기 어렵다면 연구원 퇴사를 사유로 자진취소하는 경우도 있습니다.

정리

연구개발전담부서는 자격을 갖춘 연구전담요원 1명과 구분된 연구공간, 연구 전용 기자재, 연구 외 업무를 하는 상시 종업원을 갖추면 시작할 수 있는 작은 R&D 조직입니다. 실제로 연구개발을 하는 소규모 회사라면 먼저 검토해 볼 만하지만, 인증용으로만 만들기보다 유지할 수 있는지부터 따져 보세요.

Sources

이 글은 작성일 기준 공고·가이드북을 바탕으로 정리한 일반 정보입니다. 기업의 업종, 업력, 매출 및 상황에 따라 적용 조건은 달라질 수 있으며, 개별 세무·법률 사항은 전문가 확인이 필요합니다. (기준일: 2026. 11. 7.)

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